<div id="frameblock-simple">
 <iframe id="frame-simplereg" frameborder="0" src="/index.php?route=account/simpleregister" >
    Ваш браузер не поддерживает плавающие фреймы!
 </iframe>
</div>

var iframe = document.getElementById('frame-simplereg'); // фрейм
var iframeDoc = iframe.contentWindow.document; // загружаемый во фрейме документ
iframeDoc.onload = function(){ // ждём загрузки документа во фрейме
	var simpleReg = iframeDoc.getElementsByClassName('simple-content')[0]; // блок внутри загружаемого во фрейме документа. Эту строку браузер пропускает без объяснения причин.
	iframe.style.height = simpleReg.offsetHeight + 'px'; // изменяем высоту фрейма в зависимости от высоты блока во внутреннем документе
}

$(document).ready( function(){
/* Мозилла и старая Опера не показывают фрейм на той же странице, которая загружается через него, т.е. на странице регистрации, поэтому на ней мы удаляем код всплывающего окна из DOM */
var hostLength = window.location.hostname.toString().length + 7; // находим длину начальной части url: http:// + domain
var windowLock = window.location.href.toString().slice(hostLength); // отсекаем начальную часть url, оставляем "хвост"
if( windowLock === '/index.php?route=account/simpleregister' ){ // если это страница регистрации
	$('#showarcticmodal').remove(); // удаляем код плашки
	$('#arcticmodal').remove(); // удаляем код всплывающего окна
	return;
	}
var iframe = $('#frame-simplereg'); // фрейм
var frameblock = $('#frameblock-simple'); // блок, обрамляющий фрейм
iframe.load( function(){
	var iframeDoc = iframe.contents(); // загружаемый во фрейме документ
	var simpleReg = iframeDoc.find('.simple-content').get(0); // блок внутри загружаемого во фрейме документа(форма регистрации).
	if( !iframeDoc || !simpleReg ){ // IE не даёт доступ к содержимому фрейма, поэтому ставим размеры с запасом
		frameblock.get(0).style.height = '600px';
		iframe.get(0).style.height = '770px';
		}
	else{ // изменяем размер блока с фреймом, в зависимости от высоты формы
	frameblock.get(0).style.height = 50 + simpleReg.offsetHeight + 'px';
	iframe.get(0).style.height = 50 + 170 + simpleReg.offsetHeight + 'px';
	}
})
});

1. А как сюда iframe.css('height', 50 + 170) добавить высоту формы simpleReg.offsetHeight, тем более если она может динамически изменяться? Я jquery не знаю почти, мне пока ванильный js ближе, это написал потому, что на сайте весь js через библиотеку эту сделан.
   
2. Не знаю почему, но у меня фрейм не растягивает родительский блок и всплывающее окно схлопывается.
   
3. Выводил в консоль переменные загружаемого во фрейме документа и формы в нём, IE 9 написал, что они не определены. Домен один и тот же.
   
4. Я не хочу страницу регистрации изменять, я хочу только, чтобы она во фрейме по-другому выглядела. Это можно сделать через js, но больно геморройно и по-быдлокодерски как-то, да и ишак не даст по вышеизложенной причине. Кроссбраузерно и просто сделать похоже не получится.

alert(window === window);

alert(window === window.window);

alert(window === window.window.window.window.window.window.window.window);

if( window.top !== window.self ){
	var style = window.top.document.createElement('style');
	style.innerHTML = '.simple-content{background: green;}';
	window.top.document.head.appendChild( style );
}

element.className += ' special-class';

iframeDoc.find('.simple-content').addClass('h1backgr');

iframeDoc.find('h1').addClass('h1backgr');