если ячейки двух соседних строк одинаковы красим их , цвет выкусываем из начала массива , иначе возвращаем использованный цвет в конец массива.

"новичок" кода не поймет :)
Так, по-моему мнению, код читается лучше:

(function(i) {
	var colors = ["red", "green", "blue"], use_color;
	[].forEach.call(document.querySelectorAll("#t1 tr"), function(row, index, next_row) {
		next_row=next_row[++index];
		if(row.cells[i].textContent == next_row.cells[i].textContent){
			use_color=use_color || colors.shift();
			row.style.backgroundColor = use_color;
			next_row.style.backgroundColor = use_color;
		}else if(use_color){
			colors.push(use_color);
			use_color=undefined;
		};
	});
})(0);

Стало чуть понятнее, не подумал про массив цветов, где можно добавлять в конец массива первый элемент, век живи, век учись

:thanks: :yes:

можно если массив короткий, на больших массивах этот способ будет затратным и лучше будет брать цвет по индексу