как запустить функцию после другой функции
 

вопрос, как запустить функцию B после исполнения функции A ?

A();
B();

Кэп.

нет, функция А начинает исполнятся во время исполнения функции В, а надо что бы по завершении исполнения... в общем хочу сделать что бы пока функция В исполняется, кнопка вызова этой функции была не активна, а как закончила исполнятся, стала активна

Ну, предположим, ваша функция A исполняется 3 секунды, потому что в ней цикл до 100500000, вы не сможете нажать ничего в этот момент. Пример-то приведите

// НЕ ЗАПУСКАТЬ
var i = 1e10; while (i--){}

Можете попробовать

в общем вот после этого надо запустить функцию A

k2=k;
				ml_2=new YMaps.YMapsML(ml_href+'2.php?'+zapros);
				YMaps.Events.observe(ml_2, ml_2.Events.Load, function () {
					obj2 = this.filter(function (obj2) {
						return (obj2.name)
					})
					cluster.addPlacemarks(obj2);
				})

после того как массив obj2 добавится в кластер (cluster.addPlacemarks(obj2);)

А, так вот что вы имели ввиду под одновременным выполнением функции. Я так понял это асинхронные операции с колбэком. Так вызвайте A прямо после cluster.addPlacemarks(obj2);

k2=k;
ml_2=new YMaps.YMapsML(ml_href+'2.php?'+zapros);

YMaps.Events.observe(ml_2, ml_2.Events.Load, function () {
    obj2 = this.filter(function (obj2) {
        return (obj2.name);
    });
    cluster.addPlacemarks(obj2);
    A(); //ВОТ ТУТ. Кэп
});

не совсем поняли, сейчас подробнее опишу ситуацию)
весь код расписывать не буду, приведу пример, в общем пока выполняется функция B, кнопка должна быть не активна, после выполнения функции, кнопка должна быть активна, переменные r1 и r2 могут быть обе равны 1 одновременно, всегда по разному, смотря что пользователь нажмет

function B(){
$("#button").attr('disabled', true);//дизактивируем кнопку
 if (r1==1){
  cluster.addPlacemarks(obj1); //занимает n-е время
 }
 if (r2==1){
  cluster.addPlacemarks(obj2); //занимает n-е время
 }
}
function A(){
 $("#button").attr('disabled', false);
}

aa, понял какая операция асинхронная. Я с этим API не работал, надо вам доки читать, мне кажется что 100% по завершению запроса поджигается какое то событие или возвращает что-то типа Deferred