как лучше писать?
 

никак не успокоюсь) чтобы вопрос был конкретный опишу пару вариантов
1 вариант

var MainPage = {};

$(function() {
	MainPage.initSearch();
	MainPage.initSmth();
});


MainPage.initSearch = function() {
	...
};

2 вариант

var mainPage = null;
$(function(){
  mainPage = new CMainPage();
});

var CMainPage = function()
{
  this.init();
};

CMainPage.prototype.init = function()
{
  this.initSearch();
  this.initSmth();
};

CMainPage.prototype.initSearch = function()
{
  ...
}

3 вариант

$(function() {
...
}
$(function() {
...
}

4 вариант

$(function() {
	search();
	smth();
}
function search() {
	...
}

5 вариант

$(function() {
	$().search();
});

(function($) { 
	$.fn.search = function(){
		...		
	};
})(jQuery);

я голосую 4й вариант, а вы?)

5 вариант, такой конструкцией плагины для jquery начинаются

плагины это 5й вариант
3й вариант высмотрел на contribute.jquery.org

Да, отредактировал
4 вариант самый простой

так их слоган Write Less, Do More какбы намекает что проще и нужно)

статья в тему это грубо говоря 1й вариант

Паттерны могут использоваться разные, в зависимости от назначения кода.

На мой взгляд тоже 4 вариант менее трудоемкий:)