Где размещать библиотеку и сценарии
 

страница формируется с помощью XLMT проца , куда и как использовать jquery для созданный обьектов , и как к ним обращаться в этом случаее на jquery.com указано , что если файл сформирован из PHP то скрипт надо включать в Body, есть ли еще какие либо особенности в моем случае ?

и понятен ли вопрос ? :yes:

Также, как и всегда.

HTML-странице в общем и скрипту в частности абсолютно все равно, чем они сформированы.

Нет.

Нет.