А мне вот интересно, т.к. этот проект 2014 года и я подрублю все это на свежую версию php не будет ли ошибок?)

То есть вершина дерева это потомок? И как оно в базе описывается? Какова максимальная глубина вложения может быть?

Нет в базе что бы попасть от внука к деду нужно пройти цепочку через отца...

в базу данных каждая персона имеет ссылку на id отца и матери

Вряд ли что-то будет серьезное, если только мелочи, которые легко будет подправить. Все зависит от того что использует код, если нет ООП, то и вряд ли проблемы будут.

В MySQL это описывается так...

изначально это была французская разработка, но я решил ее допилить и познать web как бы на примерах. то есть тут есть id_indi как id персоны и id_pere как id отца и id_mere как id матери

на 4 id пока не обращайте внимание, он пока тут не фигурирует) я хочу потом сделать так, что бы если ид родителей одинаковые то записывать их в одну ячейку

Если нужно выводить древо от потомков к предкам (я правильно картинку понял?), то связь такой и должна быть - потомок родитель, все ему подчиненные, это потомки.

В общем нужно видеть представление базы, ее структуру, но запрос делается не верно, это 100% точно.

Может я и запрос не правильно сделал, т.к. я просто взял все:) возможно можно сделать нужную строку одним запросом)

Картинки не дают никакого представления о структуре базы - как связываются между собой родитель <-> потомок и потомок <-> родитель.

а что нужно предоставить?)

сами связи дополнительно хранятся отдельно :)