Сделать чтобы iframe "не открывался" в новом окне
 

Есть сайт на котором будет стоять iframe код:

<iframe src="" style="display:none"></iframe>

Сайт который будет открываться содержит такой код:

<script type="text/javascript">
if (top.location != self.location)
top.location = self.location;
</script>

И поэтому нас перекидывает на сайт который открывается в фрейме, а это нам не нужно.. как вылечить это?

Никак. Владелец сайта не хочет, чтобы его сайт загружали в iframe.