Люди, которые занимаются такими проектами, имеют все нужные инструменты для работы, и на форумах такое не спрашивают. Я думаю, автору действительно не нужны такие сложности, он просто хочешь сделать компактную сборку, один файл.

SSI ломает синтаксис в JS-файле.

Откуда-то эти нужные инструменты берутся?

Я пока что новичек в JavaScript. Мне сказали что если будет много линков , то это не есть гуд.
Но что такое именно "сборка файлов" я пока не знаком.

Да, я пока озадачился именно компактной сборкой.

Вот как тут:
http://blog.zakkum.com/?p=63
у меня не получилось.

Зачем вам, как там?
Скачиваете NodeJS под нужную систему http://nodejs.org/#download
И запускаете.

Kolyaj - спасибо. Я скачал и поставил.Но я правда не знаю как говорится "с чем это едят"
У меня открывается только консольное окно, и что в нем делать, фиг знает.
Его еще учить мне и учить. А в JS Builder операции склейки файлов наглядно делаются.

Там ещё хелп объёмный есть.

Если вам просто соединить несколько файлов, то buildjs вам и не нужен.