Является ли //@ sourceMappingURL=jquery.min.map комментарием?
 

Является ли строка
//@ sourceMappingURL=jquery.min.map
комментарием в JavaScript или она может обрабатываться?

в старых ИЕ может восприниматься как встроенный conditional comment, поэтому рекомендуется дописать слеши вначале:

////@ sourceMappingURL=jquery.min.map

Честно говоря есть сомнения, что только в старых... с некоторых пор jquery стал сыпать ошибку, запрашивая файл jquery.min.map, причем даже как-то нестабильно - то запрашивает, то нет. После проверки всех файлов в составе jquery нашел упоминание данного файла только в этой строке... Вот и думаю, в чем подвох...