Скрыть окно через определенное время
 

Есть код, который сворачивает модальное окно по клику:

$('#windowClose').bind('click',
function() 
	{
		$('#window').TransferTo(
		{
			to:'windowEnd',
			className:'transferer2', 
			duration: 400
		}
		).hide();
	}
);

Как сделать сворачивание по времени (через 2 секунды, допустим)?

Спасибо.

Это не модальное окно...

Используй setTimeout()...

А куда мне setTimeout() вписать?

Это уже решать тебе. :D
Почем мне знать когда ты решишь что пора "сворачивание по времени (через 2 секунды, допустим)"

fe1ix,
Вариант закрытия после открытия ...)))

$('#windowOpen').bind(
			'click',
			function() {
				if($('#window').css('display') == 'none') {
					$(this).TransferTo(
						{
							to:'window',
							className:'transferer2',
							duration: 400,
							complete: function()
							{
								$('#window').show();
*!*
                                window.setTimeout(function() {$('#windowClose').click()} ,2000 );
*/!*
							}

						}
					);
				}
				this.blur();
				return false;
			}
		);

используемый вами плагин устарел -- попробуйте современную версию http://api.jqueryui.com/dialog/