как подключить js-скрипт сразу к нескольким страницам?
 

Допустим имеется страница index.php а на ней два десятка ссылок на подстраницы. Как мне на главной странице подключить джаваскрипты ко всем подстраницам?

Никак, разумеется. Любая страница существует сама по себе и доступа к другим не имеет.

Как использовать один код на нескольких страницах без дублирования - выноси в отдельный файл и подключай таким образом:

<script type="text/javascript" src="ссылка_на_скрипт"></script>