forwardonly2015, тем что мешать всё в кучу - говнокод по определению.
HTML(шаблон) должен быть отдельно, css - отдельно, js - отдельно, данные из php - тоже отдельно.

Чуток конкретики, если вышеприведённые прописные истины пока для вас не очевидны: такой скрипт каждый раз генерируется и нормально не кэшируется; такую кашу сложно и противно поддерживать; ...

Это не данные из PHP, это код, сгенерированный PHP (или любым другим серверным языком, включая JS)

В каком смысле не кэшируется? Нативно? Этот код для JS-движка ничем не отличается от любого другого, никакой разницы в кэшировании такого кода не будет. Если же Вы говорите о ручном кэшировании, я не вижу тут никаких проблем. Приведите пример, какие конкретно трудности вы видите в том, чтобы закэшировать сгенерированный сервером код.

Опять же непонятно, какая разница для браузера, генерируется ли он, или читается из файла, если код все равно тот же самый.

forwardonly2015, он каждый раз генерируется заново в зависимости от данных в php, очевидно же, нэ? Соответственно каждый раз грузится с сервера, замедляя отклик.

Очевидно, что если речь идет о странице, на которой не предусмотрено изменений, сервер будет генерировать для нее совершенно одинаковый код. По сети передается только текст, браузеру плевать откуда этот текст берется. Никакой разницы нет. В статические HTML-файлы тоже никто не запрещает вносить изменения.
А какой код не грузится каждый раз с сервера? Волшебный?

Aetae,
По-моему, у Вас вобще превратное представление о кэшировании. Браузер может закэшировать между сессиями только всякую мелкую чепуху, типа картинок, да и то это опасный ход, у него нет гарантий, что ничего не изменилось между перезагрузками. Когда речь идет о кэшировании жаваскрипта, имеется в виду, в основном, некоторые повторные действия пользователя, с уже загруженными скриптами, не более того. Это вообще из другой оперы

"Ой, всё."

Aetae,
Возможно, при каждом получении страницы, которая была ранее загружена, он проверяет все файлы на изменения, проверкой контрольной суммы, или как-то еще, и в случае, если он уверен в том, что нет изменений, он достает данные из кеша. Но тут способ получения кода, опять же по барабану.