var links=page.evaluate(function() {
                    return document.getElementsByTagName('img');
                    });
                    console.log("links.length="+links.length);

                    console.log(links[0].src);//выводится нормально
                    console.log(links[1].src);//этот уже не выводится
                    for(var i=0;i<links.length;i++)
                    {
                        console.log(i);
                        console.log(links[1].src);//не выводится
                    }

<script>
    var mass= document.querySelectorAll('img');
    alert(mass.length);
    for(var i=0;i<mass.length;i++) {
        alert(mass[i].src);
    }
</script>

var urls = [
"https://site.ru/page=1",
"https://site.ru/page=2",
"https://site.ru/page=3",
"https://site.ru/page=4"
];
var numurls = urls.length;

for (u = 0; u < numurls; u++) {

    var fs = require('fs');
    var webPage = require('webpage');
    var page = webPage.create();
    
    console.log('link '+ urls[u]);
    page.open(urls[u], function(status) {
      console.log('Status: ' + status);
      if (status === 'success') {
        
        //моя обработка и запись
        
        console.log('for is end');

        //phantom.exit();
      }
    });
    
} // конец цикла 1 url

shell_exec('/usr/local/bin/phantomjs -v');

$title = shell_exec('/usr/local/bin/phantomjs /script.js http://market.yandex.ru/model.xml?modelid=8230052&hid=90594');

$title = shell_exec('/usr/local/bin/phantomjs /script.js http://market.yandex.ru/model.xml?modelid=8230052&hid=90594');

var system=require('system');
var url=system.args[1];
console.log(url);
phantom.exit();