рони,
у меня новая беда. Он точки не все отмечает. в бд они есть а на графике нет!

obj = data.reduce(function(a, b) { if (!a[b.name]) a[b.name] = []; a[b.name].push([+new Date(b.create_at), +b.counter]);return a},{});

чуть изменил ваш код

user71,
толи была проблема и вы её решили, толи проблема есть?

тут должно быть 10к точек. Вот линии которые по диагонали они без точек а в бд инфа то есть

user71,
http://savepic.net/

user71,
вашей картинки не видно залейте по ссылке выше

Кажется я понял в чем дело. Данных в бд действительно нет. Только даты не совпадают. Разница 3 часа между тем что пишет график и тем что написано в бд

формирование +new Date(b.create_at),
нужна UTC

[{"ind":317,"create_at":"2016-07-30T14:26:06.000Z" это в json приходит
317 | 2016-07-30 17:26:06
он же в бд

user71,
число даты сформировать на сервере можно?

user71,
как вариант ...

(+new Date(b.create_at)+(new Date).getTimezoneOffset()*60000)