Несколько тысяч объектов и оперативная память
 

Простенький объект Session, который хранит ID, ссылку на активное socket-соединение и, например, время последнего обращения.
Что-то такое : {ID, socket, lastTime}

Было бы логично прямо в этом объекте добавить несколько методов (например 100-200 строк кода). Но не будет ли это затратным с точки зрения использования ресурсов сервера? Если этих объектов будет несколько сотен или тысяч.

Или правильнее создать отдельный модуль для работы с этим объектом, а в самом объекте только данные.

но совсем понятно что точно хотите, но методы лучше хранить на прототипе.

Переформулирую.
Проектирую объект, который будет существовать в большом количестве экземпляров. Не будет ли полезным и целесообразным вынести код из него в отдельный модуль в целях оптимизации...

Вынести код из объекта?
глянуть пример можно, что за объект и что хотите выносить

yinfo, вы буквально объект хотите использовать или все же класс?
Если это будет класс, то можно создавать любое кол-во методов, они не будут дублироваться в памяти для каждого экземпляра.

Именно класс.

module.exports = class SocketSession {
    constructor(socket, sessionId, user) {
        this.sessionId = sessionId
        this.socket = socket
        this.user = user
    }
}

"они не будут дублироваться в памяти для каждого экземпляра" - собственно это я и хотел услышать, спасибо.

А почему class es6, а экспорт es5? )

Спасибо за замечание )

И главным образом из-за

export class SocketSession {
^^^^^^

SyntaxError: Unexpected token export

Хотя в настройках Webstorm указан ES6

нужен babel с каким-нибудь пресетом ) типа es2015, stage-0 и т.д.