Загрузка файлов на GitHub
 

Основная проблема в том, что я использую хостинг HEROKU и мне надо сохранять информацию о пользователях в .json файл, который также находится на гитхабе. Вопрос: как это сделать если метод через

require('fs')

не работает?

1) require() - это не метод, а функция.
2) Github не поддерживает редактирование файлов в хранилище, с помощью кода. Используйте repl.it в качестве хостинга (в связке с UptimeRobot) и хранилища файлов.