Повторяю ответ: пауза в цикле не нужна.

Вызов чего-либо по временному интервалу в JavaScript осуществляется с помощью интервалов и таймеров(setInterval, setTimeout). Циклы в этом вообще не участвуют.

Читайте статьи по ссылкам в этой теме до полного понимания.

var i = 3; //кол-во повторений;
var interval = setInterval( //задаём интервал
	function(){ //анонимная функция обёртка, вместо неё можно передавать функции по имени
		soundManager.play('mySound2'); //исполняем нужный вам код
		if(--i <= 0) clearInterval( interval ); //если закончилось заданное кол-во повторений - сбрасываем интервал 
	},
	3 * 1000 //время повтора в мс 
)

Приветствую. Ребят, я опять за помощью. :)
function Zazor($)
{
if($==1) clearTimeout(zazor);
else var zazor = setTimeout("alert('Приехали')", 4000);
}

<span onclick="Zazor()">Зеленый</span><br>
<input type="button" value="Останов" onclick="Zazor(1)" />

При клике на "Зеленый" запускается таймер,
при клике на "Останов" таймер не выключается.
Как это поправить?

Вы используете локальную переменную zazor, и естественно, что при каждом выполнении функции она не равна своему предыдущему значению
Используйте либо глобальную переменную, либо используйте замыкание

function Zazor($)
{
if($==1) clearTimeout(zazor);
else var zazor = function(){
setTimeout("alert('Приехали')"}, 4000);
}

так что ли...
не работает.
И странно,что нельзя без всяких условий этосделать и останавливать кнопкой (clearTimeout(zazor)), потому что alert срабатывает сразу же,не дожидаясь 4 сек.

Нет разумеется.
Вы написали синтаксически неверный код, который заведомо не будет выполнятся
Перечитайте еще раз мой ответ
Если замыкания для вас слишком сложны, то используйте более простой вариант, описанный мною до слова "либо"

JSBeginner,
то что вы хотите в цикле сделать НЕЛЬЗЯ итерация цикла проходит за сотые доли секунды и то что вы ставите на setTimeout будет выполнятся в одно и тоже время

function Zazor($)
{
if($==1) clearTimeout(zazor);
else var zazor = function(){// вы создали локальную переменную которую уже нельзя будет остановить вызовом другой функции (другой контекст)
setTimeout("alert('Приехали')"}, 4000);
}

как вам Gvozd уже сказал используются разные переменные, надо так

<script>
var zazor = null;//глобальная переменная которую можно использовать везде
function Zazor($)
{
if($==1) clearTimeout(zazor);
else zazor = setTimeout("alert('Приехали')", 4000);
}
</script>
<span onclick="Zazor()">Зеленый</span><br>
<input type="button" value="Останов" onclick="Zazor(1)" />

Спасибо за пояснения,теперь все работает.
Далее вот это...
var ovec =0;
var zazor;
// Игровые функции
function ivolga(so,put)
{
if(so!=0)
{
clearTimeout(zazor);
ovec++;
if(so != cvet[ovec]){ //проверка совпадения цветов
soundManager.play('mySound5');
return;
}else if(ovec==cvet.length){ //проверка окончания серии
alert('Победа!');
return;
}
soundManager.play('mySound' + so);
return
}
}

// формирование цветов
var cvet = [];
function Start()
{
cvet.length=0;
ovec=0;
for(var i=0;i<2;i++){ // генерируем цвета
cvet.push(getrandom(1,4));
}
}

<span onclick="Start()">Пуск</span>
<br>
<span onclick="ivolga(1)">Желтый</span><br>

Вот вроде все правильно, но почему-то всегда идет ошибка совпадения цветов и "победа" тоже не наступает.. :)

Тут уже разобрался. В функции Start() переменной ovec нужно -1 присваивать, и далее эту же переменную правильно сопоставлять.