[Sweet]

Skipp,
а когда главы закончатся, нужно читать document.read(undefined)? Тогда уж как-то так:

while(true){
  document.read(glava[i]);
  document.write(paktikum[i]);
  if( ++i < glava.length) continue;
  if( knowledgeTest() ) break;
  i = 1;
};