[melky]

к генерации которой я не имею доступа, соответственно я не могу прописать никакого id таблице, события onmouseover и т д. Также я не могу подключать никакие CSS, но зато есть возможность подключения JavaScript ну или Jquery.

если имеете возможность подключить скрипты, то вы сразу всем этим овладеваете.

..

по делу

лучше это делать через CSS.

как? живой пример

<table   border=0 cellspacing=1 cellpadding=2><tr><td>content</td><td>content</td></tr><tr><td>content</td><td>content</td></tr></table>



<script>
;var S =((function(){

        var a = document.getElementsByTagName('style');

        return a.length ?  a[0]:
        document.getElementsByTagName('head')[0].appendChild( document.createElement("style") );


})());

S = S.sheet ? S.sheet : S.styleSheet;

var R = S.rules ? 'rules':'cssRules';

function add(selector,rule) {

                 S.addRule ? S.addRule( selector, rule,S[R].length ):S.insertRule( selector+"{"+rule+"}",S[R].length )

}

add("table", "background-color:red;");


add("tr:hover td", "background-color:green;");

</script>