Ну тогда приступим.
Я так понял, что в строке node.getElementsByTagName('a')[0], 0 - это номер ссылки по порядку, верно или нет?
Предположим, что да, тогда может такой вариант?
<script language="JavaScript" src="http://domain.net/links/name.js"></script>
<script language="JavaScript">
var iframe = document.createElement('iframe');
iframe.src = node.getElementsByTagName('a')[1];
iframe.style.width = 468;
iframe.style.width = 300;
document.getElementsByTagName('body')[0].appendChild( iframe );
</script>
?