[Zibba]

Это будет выглядеть как то так:

window.onload = function(){
	var n = 5;// кол-во строк таблицы
	var i = 1;
	var tr = document.getElementById('tr'+i);

	setInterval(function(){
		tr.style.backgroundColor = '#ffffff';
		tr = document.getElementById('tr'+i);
		if(i <= n){
			tr.style.backgroundColor = '#eeeeee';
			i++;
			if(i > n) i = 1;
		}
	}, 1000);
}

<table>
	<tr id="tr1">
		<td>1</td><td>Hello World !!!</td>
	</tr>
	<tr id="tr2">
		<td>2</td><td>Hello World !!!</td>
	</tr>
	<tr id="tr3">
		<td>3</td><td>Hello World !!!</td>
	</tr>
	<tr id="tr4">
		<td>4</td><td>Hello World !!!</td>
	</tr>
	<tr id="tr5">
		<td>5</td><td>Hello World !!!</td>
	</tr>
</table>