Читал, но там все больше свойства к прототипу цепляют...
А хочется свой класс сделать

Вариант с __proto__ не нравится.
Этак можно просто сделать

x.arr = []
x.arr[0] = 5;
alert(x.arr.length)
....

Но какое ж это наследование.

Может проблема в подходе. В JavaScript просто плохо применимы методы ооп из типизированных языков, а нужно действовать по другому?