Одна из наиболее часто возникающих проблем, является как раз таки эта. И это не зависит от фактора - новичок ли допускает ее, либо же кодер со стажем. Человеческий фактор тут играет большую роль.
Одним очень интересным инструментом является -
Dojo Toolbox. Позволяет быстро создавать, просматривать API документацию в режиме оффлайн и предостовляет графический Dojo build tool ( инструмент сборки Dojo ).