проверяйте, открыто ли окно.
если открыто, изменяйте его URL
var win, href="http://моя_страница.aspx";
var features = "height=400, width=400, menubar=no,location=no,resizable=yes,scrollbars=no,status=no";
if (!win) win = window.open(href, "somename", features);
else win.location.href=href;