[рони]

ksevelyar,
до увеличения i никогда не доходит ... строка 12 это конец вашей функции
Рабочий вариант ...

str ="<pre>apple</pre> and <pre>orange</pre>";

 blocks = /\<(h[1-6]|pre|div|ul|)\>([\s\S]*?)\<\/\1\>/gi;

 i=0;
 var tmp_blocks = new Array();

 str = str.replace(blocks, storeblocks);

 function storeblocks(x) {
          tmp_blocks[i] = x;
          return "dummy"+i++;

}

alert(str);