[Pavel M.]

задача - нужно получить содержимое которое находится между span#anchor0 и span#anchor1, причем span#anchor1 может быть как после span#anchor0 так и перед, плюс между ними может быть не только текст но и теги.

так пойдет ?

var string='Hello  <span id="esui0" class="bold">a<span id="esui0"  class="underline">mig</span>o</span>)<span  class="inactive" id="anchor1"></span>some text<span  class="some-class">and some text</span><span  class="inactive" id="anchor0"></span>';

var re = /<span[^>]+id="anchor(0|1)"><\/span>([\s\S]+)<span[^>]+id="anchor(0|1)"><\/span>/;

var res = re.exec(string);

if (res) {
    alert(res[2]);
}