Во-первых, таким образом должны шифроваться фотографии и т.п., а за одно и яваскрипт. Во-вторых, при подключении яваскрипта передаются функции только те, которые будут использоваться на странице. Остальные догружаются средствами аякс. Ссылки не шифруются таким образом.
Когда я в браузерную адресную строку вставляю адрес "http://mysite/test.js" или "http://mysite/codename" в браузер выводится одно и то же:
alert("ок");
"супер/пупер сгенереной ссылки" - это о чём?