Спасибо, всем, теперь понял

Должно быть так
var arr1 = [1,2,3];
var arr2 = [1,2,0,4];
var a = function (arr1,arr2){
if ( (arr1 == arr2)){
return true;
}
return false;
}(arr1,arr2);
var b = function (arr1,arr2){
if ( arr1 === arr2){
return true;
}
return false;
}(arr1,arr2) ;
alert( "Проверка на равенство двух разных массивов "+ a + "Проверка на идентичность двух разных массивов " + b )