var a = [
"Вот просто ссылка на ютуб [url]http://youtube.com[/url] - она так и останется, и эта тоже - youtu.be/",
"A от этой останется только айдишник - http://youtube.ru/wUQfvbBRnZs",
"И от этой тоже - www.youtube.com/watch?v=qwUQfvbBRnZs"
];
for( var i = 0; i < a.length; i++ ) {
alert( a[i].replace( /(?:(?:https?:\/\/)?.*?\.(?:ru|com)\/(?:watch\?v=)?([\w]*)|(.*))/gi, "$1" ) );
}