[Caminante]

1. Как мне ее получить чтобы потом обрабатывать столкновения? добавляю в объект flover:

posX: function(){
return x
}

но alert(flower.posX) печатает мне function(){return x}

Попробуйте так:

var p = flower.posX();
alert(p);

2. допустим я захочу на игровое поле добавить еще цветок: flower.init(150, 150,sprite);

как мне теперь обратиться к нужному? например я захочу переместить 1й или 2й или скажем остановить анимацию какого-то из них

Можно присвоить создаваемый объект переменной и таким образом обращаться к ней. Например, var rose = flower.init(150, 150,sprite). Если цветов будет много, можно создать для них массив и обращаться по порядковому номеру.