[lancer]

Они показывают значения относительно окна браузера. И если элемент находится в центре окна и не равен размерам окна, то вывод значений этих свойств некорректен

Если дело в этом, и тебе нужно нормально считывать координаты элемента.

Давно писал самописные всплывушки(см. аттач). Может стиль не супер, но сейчас посмотрел в FF и в IE9, все работает, как и прежде. Для оперы только надо изменить поправку и снести все касающееся IE6-IE7.

//вычисляем координаты элемента и относительно их устанвливаем подсказку
		var coords=getOffset(this);
		document.getElementById(help_up_id).style.top=coords['top'] - 85 + 'px'
		document.getElementById(help_up_id).style.left=coords['left'] - 14 + 'px';
		
		//поправки для нехороших браузеров.
		if (/MSIE (5\.5|6).+Win/.test(navigator.userAgent))
		{
			document.getElementById(help_up_id).style.top=coords['top'] - 73 + 'px';
			document.getElementById(help_up_id).style.left=coords['left'] - 8 + 'px';
		}
		
		if (/MSIE (7).+Win/.test(navigator.userAgent))
		{
			document.getElementById(help_up_id).style.top=coords['top'] - 70+ 'px';
		}
		
		var ua = navigator.userAgent.toLowerCase();
		isOpera = (ua.indexOf("opera") != -1); 
		if (isOpera){
			document.getElementById(help_up_id).style.top=coords['top'] - 73 + 'px';
		}
		
		//Подсказкам для ссылок небольшая поправка координат вправо и вниз. 
		if(this.tagName=='A')
		{
			var help_top=parseInt(document.getElementById(help_up_id).style.top);
			var help_left=parseInt(document.getElementById(help_up_id).style.left);
			
			//поправки для нехороших браузеров.
			if (isOpera){
				document.getElementById(help_up_id).style.top=help_top +6 + 'px';
				document.getElementById(help_up_id).style.left=help_left +35 + 'px';
			}
			else if
			(/MSIE (5\.5|6).+Win/.test(navigator.userAgent))
			{
				document.getElementById(help_up_id).style.top=help_top +6 + 'px';
				document.getElementById(help_up_id).style.left=help_left +35 + 'px';
			}
			else if
			(/MSIE (7).+Win/.test(navigator.userAgent))
			{
				document.getElementById(help_up_id).style.top=help_top + 6 + 'px';
				document.getElementById(help_up_id).style.left=help_left +35 + 'px';
			}
			else
			{
			document.getElementById(help_up_id).style.top=help_top + 19 + "px";
			document.getElementById(help_up_id).style.left=help_left + 35 + "px";
			}
		}