Разобралась) чтобы была строка код такой:
function checks() { 
		var cbx = document.getElementById("flags").getElementsByTagName("input"), msg= "";
			for (i=0; i < cbx.length; i++) {
				if (cbx[i].type == "checkbox" && cbx[i].checked) {		
					msg += "" + cbx[i].value +"" ;	
				}
			}
			alert(msg);	
	}
