[Aetae]

Имхо, обратный цикл в данном случае няшнее:

function placeZero( data ){
	var j = data.length;
	while(j--){
		var arr = data[j], i = arr.length;
		while(--i){
			var time1 = arr[i][0], time2 = arr[i-1][0];
			while((time1-=60) !== time2) arr.splice(i,0,[time1,0]);
		}
	}
}