В jquey я ламер, но могу предложить решение на PHP:
Берём код
<ul>
<li><a href='#'>MENY-1</a>
<ul>
<li><a href="#">ssss</a></li>
<li><a href="#">ssss</a></li>
</ul>
</li>
<li><a href="#">MENY-2</a>
<ul>
<li><a href="#">ssss</a></li>
<li><a href="#">ssss</a></li>
</ul>
</li>
<li><a href="#">MENY-3</a></li>
<li><a href="#">MENY-4</a></li>
</ul>
Немного PHP:
// Чтобы сильно не усложнять основное регулярное выражение удаляем
// все переходы на новую строку, возвраты каретки и табуляции
$txt = preg_replace("/[\t\r\n]/", "", $txt);
// Замена всех одинарных кавычек на двойные (опять таки для упрошения основного RegEx-выражения)
// если Вы гарантируете, что значение атрибута Href ограничено только двойными кавычками, то это
// действие можно пропустить
$txt = preg_replace("/(<[^>]*)'([^']*)'([^>]*>)/", '$1"$2"$3', $txt);
// Собственно удаление не нужных ссылок
$txt = preg_replace("/<li><a href=\"[^\"]\">([^<]*)<\\/a><ul>/i", "<li>$1<ul>", $txt);
print $txt;
Вот результата
<ul>
<li>MENY-1
<ul>
<li><a href="#">ssss</a></li>
<li><a href="#">ssss</a></li>
</ul>
</li>
<li>MENY-2
<ul>
<li><a href="#">ssss</a></li>
<li><a href="#">ssss</a></li>
</ul>
</li>
<li><a href="#">MENY-3</a></li>
<li><a href="#">MENY-4</a></li>
</ul>
P.S.: Данные регулярные выражения не претендуют на звание идеальных, но у меня багов не было.