[ololosh]

А почему может быть такое, что подложка

#podlogka {
			position: absolute;
			top: 0;
			left: 0;
			width: 100%;
			height: 100%;
			background: #000;
			opacity: 0.6;
			z-index: 100;
		}

#modalWindow {
			margin: 100px auto 0;
			width: 400px;
			overflow: hidden;
			z-index: 10001;
			border: 1px solid #4c6a8a;
		}

имея более низкий з-индекс, чем моё модальное окно, блокирует это самое окно?