[DjDiablo]

Продемонстрирую на примере обычного слайдера.

Тут две отдельных операции.

1) формируешь HTML при помощи PHP
2) пишеш скрипт который подключает слайдер к html


Действие 1 формируешь HTML при помощи PHP
допустим для этого слайдшоу http://ruseller.com/lessons.php?rub=32&id=400
нужно сформировать html вида

<div id="s1">
<img src="img/beach1.jpg" />
<img src="img/beach2.jpg" />
<img src="img/beach3.jpg" />
</div>

пишем

<div id="s1">
     <? $images=Array("beach1.jpg","beach2.jpg","beach3.jpg" ); ?>
     <?php foreach ($images as $i) { ?>
          <img src="<?=$i ?>" />
    <?}?>
</div>

Действие2
подключаем небольшой JS скриптик содержащий

$(document).ready(function() {
    $('#s1').cycle('scrollDown');
});

ENJOY!

з.ы.
Мне очень ненравится что ты готовишь данные прямо в шаблоне. Либо подготовь массив заранее, ещё до шаблона. Либо вынеси подготовку данных в хелпер.