[Dmitriyff]

на мой взгляд у вас оба варианта некорректны,

для каждого нового объекта будет создаваться новая функция, хорошо, пусть там будет не алерт, а супер мега крутая функция по вычислениям, строк эдак на ..., и каждая такая функция будет создаваться каждый раз для нового объекта, правильно будет вынести эту функцию

var SuperFunc = function() {
  // n-строк
};

var Obj = function() {

  this.SuperFunc = SuperFunc;
};

var o1 = new Obj();
o1.SuperFunc();

var o2 = new Obj();
o2.SuperFunc();

var Obj = function() {

  this.SuperFunc = function() {
  // n-строк
};
};

var o1 = new Obj();
o1.SuperFunc();

var o2 = new Obj();
o2.SuperFunc();

первый вариант съест меньше памяти