Возможно. Просто напишите в .js файле её объявление
doCoolStuff = function() {
alert('123');
}
Правда , в таком случае она станет глобальной, что не очень хорошо. Другой вариант — указать что-то вроде
(function() {
return function() {
alert('123');
};
})()
, подгружать содержимое файла с помощью XHR, а потом выполнять eval
var fnc = eval(data)