не пользуйтесь onclick)
Пишите скрипты только в файле скрипта, например так:
$(/*пункт меню (селектор)*/).click(function() {
/*функция по клику на пункт меню, где this = тот пункт меню на который мы нажали*/
});
Тогда вам не надо писать функции для каждого пункта меню. Можно написать одну функцию на все.
Допустим меню сделано списком:
$('li').click(function() {
$('ul').find('active').toggleClass('active');//Снимаем класс актив с пункта меню
$(this).toggleClass('active');//Добавляем класс актив к кликнутому пункту
/*В таком варианте вы просто задаёте цвет для class='active' через css*/
})