$(el).load() подгружает контент через xhr запрос и присваивает el.innerHTML подгруженный контент. При этом содержимое тегов <script> не исполняется. Нужно делать что-то типа:
$(el).load(url, function(){
alert('контент загружем, запускаем редактор');
CKEDITOR.replace('editor1');
});