Ясно, значит вообще поленились разобраться в коде.
У вас есть сточка:
document.getElementById("select" + this.name).childNodes[0].nodeValue = option[d].childNodes[0].nodeValue;
Следовательно каждый <select> заменяется на элемент имя идентификатора которого состоит из приставки select и значения атрибута name каждого элемента <select>. Значит к каждому отдельному <select> можно добавить стили в CSS:
#selectselect1 {
border: 1px solid #f00;
}
#selectselect2 {
border: 1px solid #0f0;
}
#selectselect3 {
border: 1px solid #00f;
}
Пример выше поправил.