[megaupload]

надо сделать так

var wndName;

function openNewWindow(){
	wndName = open(
		'http://google.com',
		'',
		'width=400,height=400'
	);
}


function closeNewWindow(){
	wndName.close();
}

но тогда у тебя в глобальной области будет переменная wndName что не круто,

по этому круче сделать так

(function(){

var wndName;

window.openNewWindow = function(){
	wndName = open(
		'http://google.com',
		'',
		'width=400,height=400'
	);
}


window.closeNewWindow = function (){
	wndName.close();
}

})();

тогда wndName останется в замыкании обеих функций, при том в глобальной области видна не будет а будет видна только им)