[danik.js]

Для нескольких инстансов не годится.

А если так, то почему не:

var windowHandler = {
    window: null,
    open: function(url) {
        this.window = open(url);
    },
    close: function() {
        this.window.close();
    }
}

windowHandler.open("....");
windowHandler.close();

Для нескольких инстансов:

var windowManager = {
    windows: [],
    open: function(url, name) {
        this.windows[name] = open(url);
    },
    close: function(name) {
        this.windows[name].close();
    }
}

windowManager.open("....", 'MyWindow');
windowManager.close('MyWindow');

Или так:

function WindowHandler {
    this.window = null;
}

WindowHandler.prototype = {
    open: function(url) {
        this.window = open(url);
    },
    close: function() {
        this.window.close();
    }
};

windowHandler = new WindowHandler();
windowHandler.open("....");
windowHandler.close();