Если ответ всё ещё интересен то он таков:
1. Каждому полю дай другой id, на пример datepicker1.
2. При подключении же скрипта скажи что б скрипт распространялся и на этот id примерно так
<script type="text/javascript">
$(function() {
$( "#datepicker, #datepicker1" ).datepicker({
...