[megaupload]

А так же исключив их я ними не работает гит, и прочие плюшки

Я хочу исключить их не ИЗ ПРОЕКТА а из ИНДЕКСИРОВАНИЯ черт возьми.
Это, как ни странно. РАЗНЫЕ ВЕЩИ.

Возможности настраивать скопы там НЕТ....