[ruslan_mart]

вот вот я что то подобное слышал fscommand?
только это мне кажется нужно уже править флешку, а это не доступно

Ну так скачайте любую программу (например Sothink SWF Decompiler), которая импортируем swf в fla, и поменяйте там код, затем экспортируйте обратно в swf.
AS3:

import flash.external.*;
var jsClick:Boolean = true;
addEventListener(MouseEvent.CLICK, js);

function js(event:Event)
{
   if(jsClick)
   {
      ExternalInterface.call('alert', 'Привет из флешки!'); //alert('Привет из флешки!');
      jsClick = false;
   }
}