[B~Vladi]

Как лучше всего именовать id ячеек таблицы, чтобы проше было обходить в функции, но при этом не терялась уникальность поля, если страниц с такой таблицей много.

Оставьте id в покое. Обходить таблицу можно и DOM-функциями.

Как правильней всего осуществить разбор xml-файла с трехуровневой структурой?

Какая ещё трёхуровневая структура?!
Свой response вы можете получить так:

var data = req.documentElement;