[utb]

Придумал так:
При открытии модального окна убираем общий скрол со страницы.
Делаем оболочку для модального окна на всю ширину с фиксированной позицией и добавляем скрол.
и вуаля
вот если используете bootstrap:

$('#modal').on('shown', function () {
    $('body').addClass('Class');
    $('#modal-class').addClass('modal-class');
    });
    $('#modal').on('hidden', function () {
    $('body').removeClass('Class');
     $('#modal-class').removeClass('modal-class');
    });

Ну и css поколдовать и все