[Deff]

Но это не суть важна. Важен принцип.

В принципе подобная задача достаточно проста и ничем не ограничена,

<script type="text/javascript">
window.onload= function() {
  var arr=document.links;
  var chang1= "javascript\\.ru"; // Точки экранируем
  var chang2="myCite.ru";
  chang1 = new RegExp(chang1,"i");
  for (i=0;i<arr.length;i++){
    arr[i].href = arr[i].href.replace(chang1,chang2);
  }
}
</script>