posta,
решение в лоб - наверняка есть api - читайте доки
<!DOCTYPE html>
<html>
<head>
<title>Untitled</title>
<meta charset="utf-8">
<link rel="stylesheet" type="text/css" href="http://uniformjs.com/stylesheets/uniform.aristo.css">
<script src="http://code.jquery.com/jquery-1.9.1.js"></script>
<script src="http://uniformjs.com/javascripts/jquery.uniform.min.js"></script>
<script>
$(document).ready(function(){
$(":checkbox").uniform();
$('#reg-selectall').on("click", function(){
$.uniform.restore(":checkbox");
$(":checkbox").prop('checked',true);
$(":checkbox").uniform();
})
$('#reg-deselectall').on("click", function(){
$.uniform.restore(":checkbox");
$(":checkbox").prop('checked',false);
$(":checkbox").uniform();
})
});
</script>
</head>
<body>
<button id="reg-selectall">Выделить все</button>
<button id="reg-deselectall">Снять все</button>
<label><input checked type="checkbox" name="one">1</label>
<label><input checked type="checkbox" name="two">2</label>
<label><input checked type="checkbox" name="three">3</label>
</body>
</html>